Memecahkan halangan mulut（4）

Penemuan dan Derivatisasi Peptida Kitaran PTG-200
Penemuan PTG-200

Pada 2016, Protagonist mendedahkan paten (WO2016011208) untuk perencat polipeptida oral yang menyasarkan IL-23R, yang termasuk beberapa jujukan peptida linear dan kitaran yang mampu mengikat IL-23R. Terutama, urutan yang dibentangkan dalam Jadual 3A paten ini hampir menyerupai struktur yang diperoleh sebelum ini oleh MDL melalui paparan phage. Jujukan peptida linear yang disenaraikan terutamanya mengandungi struktur teras -WQDYW- (seperti ditunjukkan dalam rajah di bawah). Antaranya, molekul paling mujarab (SEQ ID NO.4) mencapai kepekatan perencatan IL-23R sebanyak 4.1 µM, dengan strukturnya terbentuk dengan asetilasi terminal-N Peptida 23.15 MDL.
Perlu dinyatakan bahawa MDL dan Protagonis pernah merundingkan kerjasama pada peptida IL-23R pada tahun 2014, semasa MDL berkongsi maklumat penyelidikannya. Pada 2015, kedua-dua pihak menandatangani perjanjian kerahsiaan, tetapi rundingan telah ditamatkan pada Oktober tahun yang sama. Dokumen undang-undang seterusnya mendedahkan bahawa MDL memfailkan tuntutan mahkamah terhadap Protagonis di Mahkamah Daerah AS, mendakwa pelanggaran paten oleh PTG-200, melibatkan paten US 8946150 (MDL) dan US 9624268 (Protagonis). Pada 2018, tuntutan pelanggaran paten MDL telah ditolak kerana Protagonis menggunakan peptida ini untuk membangunkan ubat-ubatan yang diluluskan oleh FDA untuk penyakit autoimun, yang dilindungi di bawah peraturan pelabuhan selamat.

Kembali kepada fokus artikel ini, Protagonis mengekalkan - struktur teras WQDYW yang dicadangkan oleh MDL dalam pengubahsuaian molekul berikutnya, tetapi menggunakan reka bentuk yang berbeza dalam strategi kitaran. Mereka memperkenalkan Cys ke dalam jujukan teras untuk membentuk struktur terpelihara - CXX-WQCYW - (seperti - CQTWQCYW -), dan memperoleh ratusan peptida di sekeliling struktur ini, meningkatkan aktiviti kepada tahap nanomolar (seperti yang ditunjukkan dalam rajah di bawah). Selain itu, Protagonis juga telah mencuba pelbagai kaedah kitaran, termasuk memperkenalkan ikatan tioeter antara dua tapak Cys, menggunakan tindak balas metatesis olefin (RCM), dan melaksanakan strategi kitaran ikatan amida. Walau bagaimanapun, keputusan eksperimen menunjukkan bahawa peptida kitaran oleh ikatan disulfida atau tioeter umumnya menunjukkan aktiviti yang lebih baik daripada kitaran peptida oleh ikatan RCM atau amida.

Data PK PTG-200 (kompaun C) didedahkan dalam paten: selepas pemberian oral kepada tikus pada dos 20 mg/kg, sebatian tersebut diedarkan terutamanya dalam tisu gastrousus, dengan pendedahan sistemik yang sangat rendah. Antaranya, AUC mukosa usus kecil ialah 355 μ g · h/g, dan mukosa kolon ialah 77 μ ​​g · h/g. Walau bagaimanapun, AUC dalam plasma hanya 0.3 μ g · h/mL, dengan kadar pemulihan 40% dalam najis. Kompaun ini mempamerkan kestabilan yang baik dalam pelbagai cecair gastrousus dan persekitaran yang mengurangkan: separuh hayatnya adalah lebih daripada 24 jam dalam cecair usus simulasi (SIF), cecair gastrik simulasi (SGF) dan cecair usus manusia, dan ia juga mempunyai separuh hayat lebih 2 jam dalam DTT agen pengurangan. Keputusan percubaan SPR menunjukkan bahawa ia tidak mengikat kepada IL-12R 1 sahaja, tetapi boleh mengikat pada permukaan IL-23R dan IL-12R 1/IL-23R co yang dinyatakan, dengan pertalian kuat dan nilai KD 2.42 nM dan 2.56 nM, masing-masing.

Terbitan PTG-200

Pada 2017, Protagonist menerbitkan paten keduanya untuk IL-23R peptida inhibitors (WO2017011820). Paten ini memanjangkan rangka paten pertama sebanyak 227 jujukan terbitan (SEQ ID NO.1030-1256) dan memperkenalkan unit struktur pada peptida kitaran yang boleh memanjangkan separuh hayat dalam vivo (seperti ditunjukkan dalam rajah berikut). Kajian farmakokinetik telah menunjukkan bahawa selepas pemberian oral 10mg/kg Peptide NO.1185 kepada tikus, kepekatan dalam plasma jauh lebih rendah daripada sampel usus kecil dan kolon, dan kadar pemulihan dalam najis mencapai 20% selepas 24 jam. Penilaian keselamatan menunjukkan bahawa Peptida NO.1185 tidak menunjukkan kesan perencatan pada 44 sasaran termasuk reseptor, pengangkut dan saluran ion berganding protein G pada 10 µ M.

Selepas itu, Protagonis menerbitkan beberapa paten terbitan berdasarkan struktur PTG-200 atau Peptide NO.1185, yang seterusnya mengoptimumkan aktiviti dan kestabilan melalui derivasi struktur di tapak sisa yang berbeza. Butiran pengubahsuaian yang berkaitan boleh didapati dalam paten WO2018136646, WO2020014646, WO2021007433 dan WO2021146458. Di samping itu, Protagonis juga telah memohon paten (WO2018022937) yang meliputi perencat IL-23R peptida kitaran yang mengandungi 34 asid amino, yang tidak akan dibincangkan lagi dalam artikel ini.